病毒抗体谱研究

       基于PhIP-seq技术平台，我们建立了人类病毒全覆盖的抗原库，涵盖了260种人类病毒，>1600病毒株，>9800个病毒蛋白，共计>12万条肽段。

人类病毒全覆盖抗原库(AbCode_HuVirus Proteome Lib)信息。A. 该抗原库几乎涵盖了全部人类病毒物种；B. 以新冠病毒SARS-CoV-2为例，针对任一病毒株的全部蛋白，该库均囊括其中；C. 每个蛋白的多肽设计规则，即每个蛋白切割为多条50%重叠、长度为56 aa的肽段并展示于噬菌体表面。

所涵盖的病毒株类型可下载

AbCode_HuVirus Proteome Lib_Strains.xlsx

应用案例

                           病毒免疫表位                                                        病毒抗体谱和肿瘤                                                病毒抗体谱和感染

     Shrock等利用人类病毒抗原库进行了抗病毒抗体谱构建和                 Liu等利用人类病毒抗原库构建了肝癌早期病人的                  Mina等基于人类病毒抗原库发现，麻疹病毒感染可重塑

表位分析，揭示了人群中”公共表位“及其与抗体基因序列                抗病毒抗体谱，通过统计分析，建立了肝癌预测指标            人的免疫系统，导致抗体多样性下降，既往建立的免疫屏障

之间的相关性，建立了抗体基因-公共表位-免疫个体差异的               （VES，Viral Exposure Signature），可准确诊断早             受到破坏，从而降低免疫水平（2019，Science）。

联系（2023，Science）。                                                               期肝癌患者（2020，Cell）。                                               点击查看详情

                                                                                                      点击查看详情                                                                                                                                 

参考文献

[1] Mina MJ, Kula T, Leng Y, Li M, de Vries RD, Knip M, Siljander H, Rewers M, Choy DF, Wilson MS, Larman HB, Nelson AN, Griffin DE, de Swart RL, Elledge SJ. Measles virus infection diminishes preexisting antibodies that offer protection from other pathogens. Science. 2019 Nov 1;366(6465):599-606.

[2] Liu J, Tang W, Budhu A, Forgues M, Hernandez MO, Candia J, Kim Y, Bowman ED, Ambs S, Zhao Y, Tran B, Wu X, Koh C, Surana P, Liang TJ, Guarnera M, Mann D, Rajaure M, Greten TF, Wang Z, Yu H, Wang XW. A Viral Exposure Signature Defines Early Onset of Hepatocellular Carcinoma. Cell. 2020 Jul 23;182(2):317-328.e10.

[3] Shrock EL, Timms RT, Kula T, Mena EL, West AP Jr, Guo R, Lee IH, Cohen AA, McKay LGA, Bi C, Leng Y, Fujimura E, Horns F, Li M, Wesemann DR, Griffiths A, Gewurz BE, Bjorkman PJ, Elledge SJ. Germline-encoded amino acid-binding motifs drive immunodominant public antibody responses. Science. 2023 Apr 7;380(6640):eadc9498.