噬菌体免疫沉淀测序(Phage-immunoprecipitation sequencing, PhIP-seq)技术是一种高通量抗体谱检测技术,结合了高容量噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀及高通量测序技术。该项技术可针对数十万种抗原进行血清抗体检测,全面绘制血清抗体谱,是免疫力相关研究的有力工具。
现抗码芯瑞将癌症相关文献进行整理和归纳,方便各位读者能够了解癌症领域在抗体方向研究的代表性成果。
代表性成果
1
副肿瘤综合征新biomarker鉴定
【发表期刊】NEJM
【发布时间】2019年7月
【影响因子】158.5
摘要:2019年7月,来自美国Mayo Clinic的研究团队在The New England Journal of Medicine杂志上发表了副肿瘤性脑炎自身抗体鉴定研究的文章,该研究采用噬菌体免疫沉淀测序技术(Phage immunoprecipitation sequencing, PhIP-seq)发现了10名合并副肿瘤性脑炎的精原细胞瘤患者的脑脊液及血清中的kelch样蛋白11(kelch-like protein 11,KLHL11)抗体。
该10名患者临床检测已知抗体Ma2均为阴性,本研究首次报道了KLHL11自身抗体可引发肿瘤相关性神经系统疾病,可作为精原细胞瘤相关脑炎诊断和监测的标志物,为理解该类疾病的发病原因及治疗提供了新线索。
2
鼻咽癌筛查和早期诊断新biomarker鉴定
【发表期刊】NEJM
【发布时间】2023年8月
【影响因子】158.5
摘要:鼻咽癌是一种发生于鼻咽部的恶性肿瘤,在我国及东南亚的发病率最高。全球约一半的鼻咽癌发生在我国。本研究通过设计EB病毒表位肽库,发现并验证了新型血清学标志物P85-Ab用于鼻咽癌筛查。在回顾性研究和大规模前瞻性队列中,P85-Ab均表现出优于传统双抗体方法(EBNA1-IgA与VCA-IgA)的性能,具有更高的灵敏度、特异度和阳性预测值,尤其能有效检出早期鼻咽癌。P85-Ab联合双抗体检测可进一步提升筛查的阳性预测值。结果提示P85-Ab是一种有前景的鼻咽癌筛查标志物,有望改进高危人群的早期诊断与监测。
原文来源:DOI: 10.1056/NEJMoa2301496
3
癌症免疫治疗疗效评估新biomarker鉴定
【发表期刊】Nature
【发布时间】2025年6月
【影响因子】55
摘要:细胞免疫在癌症检查点免疫治疗(CPI)中的作用已得到广泛验证,但体液免疫的功能尚不清楚。本研究利用快速细胞外抗原谱分析,系统绘制了374例CPI治疗癌症患者与131名健康对照的自身抗体反应,覆盖6,172种外泌组蛋白。结果显示,CPI患者具有显著区别于健康个体的自身抗体特征,且部分抗体与治疗反应呈强相关。这些抗体主要靶向免疫调节因子(如细胞因子、生长因子、免疫受体及肿瘤表面蛋白),并可中和其生物学功能。在临床前模型中,针对IFN-I和TL1A的自身抗体增强了CPI疗效。综上,自身抗体通过调控外泌组蛋白影响CPI反应,提示其为潜在可操作的治疗靶点,可用于提升免疫治疗效果。
4
肝癌患者早期预测新biomarker鉴定
【发表期刊】Cell
【发布时间】2022年11月
【影响因子】64.5
摘要:肝细胞癌(HCC)是一种高度侵袭性的恶性肿瘤,其在全球范围内的发病率和死亡率仍在上升,而早期检测和监测手段依然不足。本研究对1072名包含肝癌、高风险及健康对照的队列人群进行检测,获得了各组人群对病毒感染响应的抗体谱,同时通过生信分析,筛选出一组病毒抗原Viral Exposure Score(VES)模型可以准确对肝癌及健康人群进行区分。
验证阶段,作者选择了一个随访二十年的前瞻性队列人群进行测试,发现VES模型可精准识别临床确诊肝癌的患者(AUC=0.98),并且在baseline阶段即可高度识别出可能罹患肝癌的患者,效果远远优于传统的基于甲胎蛋白(AFP)检测的方法( AUC=0.91 vs. 0.62 )。
5
肝癌的病毒抗原保护效应与疫苗开发
【发表期刊】Gut
【发布时间】2025年11月
【影响因子】25.8
摘要:肝细胞癌(HCC)缺乏有效的预防策略,病毒暴露可能通过特异性抗原影响宿主免疫。本研究基于2647例受试者的全病毒血清学分析,发现HCC患者对153种病毒抗原的血清学应答显著降低,而较强应答与慢性肝病和HCC患者的更佳临床结局相关。进一步鉴定到一个来源于鼻病毒和肠道病毒家族的共有表位CE1,可诱导CD4⁺/CD8⁺ T细胞活化并介导HCC细胞杀伤。结果提示既往肠道病毒暴露可能具有抗HCC保护作用,并为病毒肽疫苗的开发提供了潜在方向。
6
肝癌患者新biomarker鉴定
【发表期刊】Cell Rep Med
【发布时间】2023年12月
【影响因子】17
摘要:肝癌是癌症相关死亡的主要原因之摘要:肝癌是癌症相关死亡的主要原因之一,部分原因在于筛查和诊断工具不足。本研究评估了肝细胞癌(HCC)和肝内胆管癌(iCCA)患者与多种疾病组和非疾病对照组的全血清学特征,以鉴别肝癌的危险因素和生物标志物。本研究检测了患者血清样本对超过1,280种致病和非致病病毒的反应,通过机器学习方法建立HCC或iCCA病毒评分,发现两种病毒评分均与多个肝功能指标呈正相关,并且在两个独立的高危人群中与病毒性肝炎状态无关。HCC评分可预测慢性肝病高危患者8年内的全因死亡率,而病毒性肝炎状态并不能预测生存。这些结果提示,非肝炎病毒感染可能促进HCC和iCCA的发生,并可作为高危人群的潜在生物标志物。
7
皮肌炎患者癌变预测新biomarker鉴定
【发表期刊】An Rheum Dis
【发布时间】2022年11月
【影响因子】27.4
摘要:本研究采用PhIP-seq技术及人全蛋白质组抗原库在43名皮肌炎(DM)血清样本中发现了一个新的自身抗体Sp4。该结果在一个包含255DM患者 、200例健康对照者、116例疾病对照者(包括抗合成酶综合征、包涵体肌炎、多肌炎等)及80例风湿病对照组本中对该结果进行了验证。通过与临床结果进行关联分析,作者发现转录因子 Sp4 自身抗体 & TIF1γ 自身抗体双阳性与皮肌炎患者癌症风险降低相关。
文献导读|Annals of the Rheumatic Diseases : PhIP-seq技术发现皮肌炎新自身抗体标志物
8
造血细胞移植后供受体体液性免疫重建特征
【发表期刊】Blood
【发布时间】2019年8月
【影响因子】21
摘要:在造血细胞移植(HCT)后,对体液性抗病毒免疫的深入研究可能有助于供体选择或患者监测。目前,体液免疫恢复的评估多依赖于淋巴细胞计数或免疫球蛋白水平,但这并不能反映对特定病毒感染的易感性。本研究利用VirScan技术系统评估了HCT前后供体与受体的病毒抗体库动态变化。对37对供受者在移植前及术后30天、100天和365天的血清样本进行检测,结果显示,供者年龄、供受者CMV血清学状态以及受者糖皮质激素使用与移植后第100天的抗体反应最为密切相关。受者抗体库在第100天时更接近供者特征,但到第365天逐渐恢复至移植前的状态。常见病毒表位的获得或丧失受供受者移植前血清学状态影响最显著,尤其在疱疹病毒和腺病毒中更为突出。本研究揭示了供体和受体对体液性免疫恢复的不同贡献,为评估免疫重建、预测临床结局及优化供体选择提供了潜在依据。
9
非小细胞肺癌疗效评估新biomarker鉴定
【发表期刊】J Immunother Cancer
【发布时间】2024年11月
【影响因子】10.3
摘要:免疫检查点抑制剂(ICBs)的应用显著改变了晚期非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗格局。然而,仅有部分患者能够从中获益,临床疗效预测仍存在巨大挑战。本研究使用VirScan技术检测不同治疗方式患者的血清样本(ICB单药、化疗(CT)或CT联合ICB治疗),全面分析表位水平的抗病毒IgG,采用独特阳性肽段总数(tUP)作为免疫应答强度的指标。结果显示,较高tUP水平与ICB治疗患者的总生存期延长显著相关(HR 0.43,95% CI 0.24–0.79,p=0.006),该相关性在CT+ICB(p=0.8)及CT治疗患者(p=0.1)中未见。tUP水平与PD-L1表达无显著关联,但在转录组水平上,tUP与多条免疫相关通路呈正相关,尤其涉及B细胞功能。较高的病毒肽段识别水平可能反映出更强的免疫适应能力,从而提升ICB治疗NSCLC患者的临床获益。
文献导读|J Immunother Cancer : PhIP-seq技术用于研究既往病毒免疫接种对ICBs预后效果的影响
PhIP-seq用于肿瘤研究的切入点
