过敏原抗体谱研究
基于PhIP-seq技术平台,抗码芯瑞建立了过敏原抗原库。我们收集整理了来自五个权威过敏原信息的公开数据库,同时补充了Uniprot数据库中注释为过敏的蛋白,共涵盖856个物种, 5,436个过敏原蛋白,对应设计了37,263条肽段,建立了噬菌体展示过敏原肽库。
过敏原抗原库(AbCode_Allergen Lib)信息。A. 过敏原来源物种示意图;B. 所参考的主要过敏原数据库;C. 每个蛋白的多肽设计规则,即每个蛋白切割为多条50%重叠、长度为56 aa的肽段并展示于噬菌体表面。
所涵盖的过敏原物种和蛋白个数数据可下载
AbCode_Allergen Lib_Species.xlsx
应用案例
过敏原关键表位鉴定 健康队列的过敏原抗体谱
Monaco等利用过敏原库分析了小麦过敏人群过敏原IgE谱, Leviatan等利用过敏原库分析了非过敏人群的
鉴定到一个关键的小麦蛋白的表位(2021,Nature Communications)。 过敏原抗体谱,分析发现这些抗体的组成以及多样性
和人的免疫状态以及疾病状态有关,比如肥胖
(2022,immunity)。
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参考文献
[1] Monaco DR, Sie BM, Nirschl TR, Knight AC, Sampson HA, Nowak-Wegrzyn A, Wood RA, Hamilton RG, Frischmeyer-Guerrerio PA, Larman HB. Profiling serum antibodies with a pan allergen phage library identifies key wheat allergy epitopes. Nat Commun. 2021 Jan 22;12(1):379. doi: 10.1038/s41467-020-20622-1.
[2] Leviatan S, Vogl T, Klompus S, Kalka IN, Weinberger A, Segal E. Allergenic food protein consumption is associated with systemic IgG antibody responses in non-allergic individuals. Immunity. 2022 Dec 13;55(12):2454-2469.e6.