膜蛋白受体鉴定

受体鉴定是生命科学研究中的重要问题。与可溶性蛋白质之间的蛋白质-生物分子相互作用相比，涉及受体-配体等膜蛋白的蛋白质-生物分子相互作用的研究更具挑战性，因为传统蛋白质鉴定方法中，维持蛋白质构象和活性较为困难。

      抗码生物在细胞表面配体的识别上，可提供两套方案供选择：

方案1：新型邻近标记技术-SPIDER+MS检测

SPIDER技术是一种新型的邻近标记技术，可兼容活细胞，直接捕获细胞表面、处于天然状态的靶标蛋白，在受体鉴定领域具有显著的技术优势。

SPIDER技术原理

应用案例：

为了测试SPIDER识别细胞表面配体的能力，我们首先检验了SARS-CoV-2 S1蛋白与其已知受体ACE2之间的相互作用，SPIDER反应直接在培养皿中进行（如下图A），我们观察到SPIDER反应前后细胞死亡率无变化。通过显示ACE2-SAm-PupE的迁移变化确认了SARS-CoV-2 S1与ACE2之间的结合（如下图B）。

SPIDER技术用于筛选和发现SARS-CoV-2 Omicron RBD新受体

与传统Pulldown+MS相比，SPIDER+MS具有显著的优势：1) 适用于膜蛋白鉴定，可支持活细胞-诱饵分子结合和检测；2）通用性强，诱饵分子可为蛋白质、抗体、DNA/RNA、小分子等多种类型；3）可检测弱相互作用。此外，SPIDER+MS比其它邻近标记技术亦有诸多优势，详见下表：

原文链接：Specific pupylation as IDEntity reporter (SPIDER) for the identification of protein-biomolecule interactions

方案2：HuProt^TM芯片—人全蛋白质组高度覆盖全长蛋白质芯片

      HuProt^TM人类全蛋白质芯片固定了>21,000种人重组蛋白，其中~90%为全长蛋白。该芯片天然是一种高质量的蛋白质自身抗原库，能够精确定位于靶点蛋白结合的小分子，并且可以实现特定环境下难以捕捉的靶标鉴定。

应用案例

JCI-芯片在乳腺癌研究上的进展（Wang et al.,2018)

       HuProt^TM人类全蛋白质芯片固定了>21,000种人重组蛋白，其中~90%为全长蛋白。该芯片天然是一种高质量的蛋白质自身抗原库，能够实现更全面和灵敏的评估。

原文链接：JCI - HIC1 deletion promotes breast cancer progression by activating tumor cell/fibroblast crosstalk